Η δικαστική διερεύνηση για την πολύκροτη υπόθεση των παράνομων επιδοτήσεων από τον ΟΠΕΚΕΠΕ οδήγησε στις πρώτες προφυλακίσεις. Ο Ευρωπαίος Ανακριτής και η αρμόδια Εισαγγελέας έκριναν προσωρινά κρατούμενους τους δύο βασικούς κατηγορούμενους, στους οποίους η δικογραφία αποδίδει τον κεντρικό ηγετικό ρόλο στην εγκληματική οργάνωση που δρούσε στην Κρήτη.
Οι αρχές κατέληξαν στην απόφαση της φυλάκισης για έναν γνωστό συνδικαλιστή του αγροτικού χώρου και έναν λογιστή από το Ηράκλειο. Και οι δύο θεωρούνται οι «εγκέφαλοι» της ομάδας που φέρεται να απομυζούσε συστηματικά ευρωπαϊκούς πόρους. Παρά τις πολύωρες καταθέσεις τους και την πλήρη άρνηση των κατηγοριών, οι δικαστικές αρχές έκριναν ότι τα στοιχεία της Ευρωπαϊκής Εισαγγελίας είναι επαρκή για να οδηγηθούν στο σωφρονιστικό κατάστημα μέχρι τη διεξαγωγή της δίκης.
Ο λογιστής από το Ηράκλειο, ο οποίος απολογήθηκε πρώτος, αντιμετωπίζει κατηγορίες για τη διαχείριση των οικονομικών ροών της οργάνωσης. Σύμφωνα με το κατηγορητήριο, ήταν ο άνθρωπος που συντόνιζε τις μεταφορές χρημάτων και την τοποθέτηση των παράνομων επιδοτήσεων σε διάφορα εταιρικά σχήματα. Από την πλευρά του, ο ίδιος ισχυρίστηκε ότι δεν υπήρξε ποτέ μέλος κάποιου παράνομου κυκλώματος. Υποστήριξε πως τα ποσά που βρέθηκαν σε λογαριασμούς του προέρχονταν από νόμιμη οικογενειακή αγροτική περιουσία και πως η εμπλοκή του με τον συνδικαλιστή αφορούσε μια απλή εξυπηρέτηση τεχνικής φύσεως.
Στη συνέχεια, ενώπιον των αρχών βρέθηκε ο θεωρούμενος ως «αρχηγός» του κυκλώματος, ένας συνδικαλιστής με ενεργή δράση και διευθυντική θέση σε Συνεταιρισμό της περιοχής. Οι κατηγορίες που τον βαραίνουν αφορούν τη διεύθυνση εγκληματικής οργάνωσης και τη νομιμοποίηση εσόδων από εγκληματικές δραστηριότητες. Του καταλογίζεται ότι υπέβαλε ψευδείς αιτήσεις ενίσχυσης, εμφανίζοντας εικονικές μισθώσεις εκτάσεων για να εισπράττει χρήματα. Κατά την τετράωρη απολογία του, ο κατηγορούμενος δήλωσε πως όλες οι ενισχύσεις που έλαβε ήταν απολύτως νόμιμες και πως, λόγω της σημαντικής προσωπικής του περιουσίας, δεν είχε κανένα κίνητρο να εμπλακεί σε τέτοιου είδους παράνομες πράξεις.
Στη συνέχεια, ενώπιον των αρχών βρέθηκε ο θεωρούμενος ως «αρχηγός» του κυκλώματος, ένας συνδικαλιστής με ενεργή δράση και διευθυντική θέση σε Συνεταιρισμό της περιοχής. Οι κατηγορίες που τον βαραίνουν αφορούν τη διεύθυνση εγκληματικής οργάνωσης και τη νομιμοποίηση εσόδων από εγκληματικές δραστηριότητες. Του καταλογίζεται ότι υπέβαλε ψευδείς αιτήσεις ενίσχυσης, εμφανίζοντας εικονικές μισθώσεις εκτάσεων για να εισπράττει χρήματα. Κατά την τετράωρη απολογία του, ο κατηγορούμενος δήλωσε πως όλες οι ενισχύσεις που έλαβε ήταν απολύτως νόμιμες και πως, λόγω της σημαντικής προσωπικής του περιουσίας, δεν είχε κανένα κίνητρο να εμπλακεί σε τέτοιου είδους παράνομες πράξεις.
